ထုတ်ကုန်များ

ပရိုတိန်းဓာတ် ဖော့စဖောရီရှင်း ကွန်ရက်များ ၏ ကြီးမားရှုပ်ထွေးမှုကြောင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း ဖြစ်ရပ်များကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းသည် အဓိက စိန်ခေါ်မှုတစ်ရပ် ဖြစ်နေဆဲဖြစ်သည်။ဤလုပ်ငန်းတွင်၊ Lys-N၊ Lys-C၊ နှင့် trypsin တို့သည် phosphoproteome ၏ ကမ္ဘာလုံးဆိုင်ရာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် ပံ့ပိုးပေးနိုင်သည့် ၎င်းတို့၏စွမ်းရည်နှင့်ပတ်သက်၍ အကဲဖြတ်ပါသည်။N-terminally acetylated၊ phosphorylated နှင့် ပြုပြင်မထားသော peptides များကို ထိရောက်စွာ ခွဲထုတ်ရန်အတွက် pH နိမ့်သော အားကောင်းသော cation ဖလှယ်မှု၏ သန့်စင်သောဗားရှင်းကို အသုံးပြုခဲ့သည်။အင်ဇိုင်းသုံးမျိုးပေါင်းစပ်အသုံးပြု၍ ပရိုတင်း 1 mg မှ <1% ၏ မှားယွင်းသောရှာဖွေတွေ့ရှိမှုနှုန်းဖြင့် စုစုပေါင်း 5036 ဖော့စ်ဟော့ပ်ပိုက်များကို ဖော်ထုတ်နိုင်သည်။မတူညီသော ပရိုတိန်းများနှင့် ထုတ်လုပ်ထားသော phosphopeptide ဒေတာအတွဲများကြား ထပ်နေခြင်းသည် နည်းပါးကြောင်း ကျွန်ုပ်တို့၏အချက်အလက်များက ဖော်ပြခဲ့ပြီး၊ အလားတူထုတ်လုပ်လိုက်သော tryptic ဒေတာအတွဲနှစ်ခုကြား ထပ်နေခြင်းသည် အနည်းဆုံး 4 ဆ ပိုမိုမြင့်မားသည်ကို တွေ့ရှိရပါသည်။ဤနည်းဖြင့် Lys-N နှင့် trypsin တို့ကို အပြိုင်အသုံးပြုခြင်းသည် d နှင့် trypsin တစ်ခုတည်းနှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက ရှာဖွေတွေ့ရှိထားသော phosphopeptides အရေအတွက် 72% တိုးလာကာ trypsin ထပ်တူပြုသော စမ်းသပ်မှုတစ်ခုမှ 25% တိုးလာခဲ့သည်။ထို့ကြောင့်၊ trypsin နှင့် Lys-N ဒေတာများကိုသာ အာရုံစိုက်သောအခါ၊ မလိုအပ်သော phosphopeptides 4671 ကို တွေ့ရှိခဲ့သည်။တွေ့ရှိသောဆိုက်များ၏နောက်ထပ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် Lys-N နှင့် trypsin ဒေတာအတွဲများသည် သိသိသာသာကွဲပြားသော phosphorylation motifs တွင်ကြွယ်ဝကြောင်းပြသခဲ့ပြီး multiprotease ချဉ်းကပ်မှုများသည် phosphoproteome ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင်အလွန်အဖိုးတန်ကြောင်းသက်သေပြခဲ့သည်။